Immer noch fliehen die letzten überlebenden Menschen vor den erbarmungslosen Cylonen durch die Tiefen des Alls. Nach dem furchtbaren Attentat auf "Galactica"-Commander Adama (Edward James Olmos) spitzt sich die Lage zu: Sein alkoholkranker Stellvertreter Colonel Tigh verkündet das Kriegsrecht. Zahllose Schiffe der Raumflotte schlagen sich auf die Seite von Präsidentin Laura Roslin (Mary McDonnell), der die Flucht nach Kobol gelungen ist. Hier soll sich die Wiege der Menschheit befinden und der Schlüssel zur letzten Hoffnung der Flüchtenden - ein Reiseplan zur Erde. Während die Cylonen neue, heimtückische Attacken starten und sich die Präsidentin gegen den rebellischen Politiker Tom Zarek (Richard Hatch) wehren muss, taucht ein zweiter Kampfstern namens "Pegasus" auf - und provoziert einen tödlichen Kampf mit der "Galactica" ...
